หน้ากากทางการแพทย์สามารถแบ่งออกเป็น: หน้ากากป้องกันทางการแพทย์, หน้ากากผ่าตัดทางการแพทย์, ธรรมดาหน้ากากอนามัย.
หน้ากากป้องกันทางการแพทย์เหมาะสำหรับการป้องกันการติดเชื้อทางเดินหายใจทางอากาศโดยบุคลากรทางการแพทย์และเจ้าหน้าที่ที่เกี่ยวข้อง หน้ากากป้องกันทางการแพทย์สามารถป้องกันเชื้อโรคส่วนใหญ่ เช่น แบคทีเรียและไวรัส WHO แนะนำให้บุคลากรทางการแพทย์ใช้หน้ากากป้องกันอนุภาคเพื่อป้องกันการติดเชื้อไวรัสในอากาศในโรงพยาบาล
หน้ากากอนามัยทางการแพทย์เหมาะสำหรับการป้องกันขั้นพื้นฐานของบุคลากรทางการแพทย์หรือบุคลากรที่เกี่ยวข้อง เช่นเดียวกับการป้องกันเลือด สารคัดหลั่งจากร่างกาย และน้ำกระเซ็นในระหว่างหัตถการที่รุกราน ควรออกหน้ากากอนามัยทางการแพทย์แบบใช้แล้วทิ้งให้กับผู้ป่วยทางเดินหายใจที่น่าสงสัยเพื่อป้องกันบุคลากรอื่นที่อาจเสี่ยงต่อการติดเชื้อลดความเสี่ยงของการติดเชื้อข้าม แต่การหลีกเลี่ยงการติดเชื้อไม่ได้ผลเท่ากับหน้ากากป้องกันทางการแพทย์
สามัญหน้ากากอนามัยใช้เพื่อปิดกั้นพวยกาจากปากและโพรงจมูก และสามารถใช้เพื่อการดูแลสุขอนามัยแบบครั้งเดียวในสภาพแวดล้อมทางการแพทย์ทั่วไป เหมาะสำหรับกิจกรรมดูแลสุขอนามัยทั่วไป เช่น การทำความสะอาดสุขอนามัย การจ่ายของเหลว ทำความสะอาดเตียง ฯลฯ การปิดกั้นหรือการป้องกันอนุภาคอื่นที่ไม่ใช่จุลินทรีย์ เช่น ละอองเกสรดอกไม้
